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Etude de l'activité des antibiotiques sur les germes isolées au service de bactériologie du laboratoire universitaire de Butare de 1991 à 2000. A propos de 8047 souches.

Dr. NKURIKIYINFURA Jean baptiste, BAYINGANA Claude, TWAGIRUMUKIZA Marc et al

RESUME :

Au cours de l'année 2001, une étude a été réalisée au Laboratoire Universitaire de Butare (Rwanda) sur l'étude de l'activité des antibiotiques sur les germes isolés au service de bactériologie de 1991 à 2000. La sensibilité des souches a été testée par la méthode des disques.
Ainsi les résultats suivants ont été obtenus : Les aminosides et la ciprofloxacine agissent d'une façon satisfaisante sur tous les germes étudiés.
Par contre l'ampicilline et l'amoxicilline ont montré une activité médiocre sur presque tous les germes.
La nitrofurantoïne a montré une bonne activité sur tous les germes à l'exception des proteus, Acinétobacter et Pseudomonas.
L'acide nalidixique a montré une très bonne activité sur tous les germes étudiés à l'exception des Pseudomonas.
Les autres antibiotiques ont montré une bonne activité sur certains germes et une activité moyenne ou médiocre pour d'autres.

I. INTRODUCTION

Les antibiotiques sont, dans le sens le plus commun de ce terme, les médicaments des maladies infectieuse bactériennes ou mycosiques, c'est-à-dire des agents antimicrobiens non ou relativement peu toxiques pour l'organisme, de sorte que l'on peut, du moins pour la plus part d'entre eux, les administrer par voie générale, condition nécessaire au traitement de la majorité des infections. (DUVAL J. ;SOUSSY C.J., 1977)
Il est de constatation quotidienne dans tout laboratoire de bactériologie clinique que de nombreuses souches bactériennes ne se comportent pas, à l'égard des antibiotiques, conformément à ce que le spectre d'activité de chacun de ces produits permettrait de supposer. En effet, depuis l'introduction successive en thérapeutique des différents antibiotiques, la sensibilité des bactéries à ces drogues a beaucoup évolué, de sorte que le pourcentage de souches résistantes dans les différentes espèces pathogènes est actuellement important.
C'est-à-dire qu'à côté de la résistance naturelle de certaines espèces bactériennes à certains antibiotiques, il existe une résistance acquise des souches à l'intérieur des espèces théoriquement sensibles. C'est dans cet optique que nous avons réalisé un travail sur l'étude de l'activité des antibiotiques sur les germes isolés au service de bactériologie du Laboratoire Universitaire de Butare de 1991 à 2000(10 ans). A propos de 8047 souches. Les résultats de notre travail permettront d'une part aux cliniciens en cas d'urgence, de prescrire les antibiotiques les plus actifs, les moins toxiques et le moins coûteux ; d'autre part ils permettront aux cliniciens ne disposant pas de laboratoire de traiter leurs malades avec le maximum de chance de les guérrir, et aux personnes responsables des commandes d'antibiotiques, de le faire d'une façon plus saine.

II. MATERIEL ET METHODES  

Notre étude porte sur 8047 souches isolées au Laboratoire Universitaire de Butare, de janvier 1991 à décembre 2000. Le comptage des souches s'est effectué à partir des registres pour antibiogramme du service. La sensibilité des souches a été testée avec la méthode des disques.
Les différents types d'antibiotiques qui ont été testés sont les suivants:
1. Chloramphénicol
2. Triméthoprime sulfaméthoxazole
3. Ampicilline
4. Nitrofurantoïne
5. Tétracycline
6. Kanamycine
7. Gentamicine
8. Céfalotine
9. Amikacine
10. Tobramycine
11. Ciprofloxacine
12. Acide nalidixique
13. Erythromycine
14. Lincomycine
15. Oxacilline
16. Penicilline
17. amoxicilline

III. RESULTATS ET COMMENTAIRES
III.1. GERMES REPERTORIES
III.2. NATURE DES PRODUITS PATHOLOGIQUES
III.3. ACTIVITES DES ANTIBIOTIQUES
  III.3.1. Activité des antibiotiques sur E.Coli
  II.3.2. Activité des antibiotiques sur Klebsiella
  III.3.3. Activité des antibiotiques sur les Salmonella sp.
  III.3.4. Activité des antibiotiques sur les Staphylocoques aureus
  III.3.5. Activité des antibiotiques sur les Staphylocoques coag. négatif
  III.3.6. Activité des antibiotiques sur les Shigella
  III.3.7. Activité des antibiotiques sur les Pseudomonas
  III.3.8. Activité des antibiotiques sur les Acinetobacter
  III.3.9. Activité des antibiotiques sur les Proteus
  III.3.10. Activité des antibiotiques sur les Enterobacter
  III.3.11. Activité des antibiotiques sur les Citrobacter
  III.3.12. Activité des antibiotiques sur les Entérocoques
  III.3.13. Activité des antibiotiques sur les Pneumocoques
  III.3.14. Activité des antibiotiques sur les Méningocoques
  III.3.15. Activité des antibiotiques sur les Gonocoques
  III.3.16. Activité des antibiotiques sur les Salmonella thyphi
  III.3.17. Activité des antibiotiques sur les Streptocoques sp.
  III.3.18. Activité des antibiotiques sur les Vibrio cholerae
IV. CONCLUSIONS ET COMMENTAIRES  

1.      E.Coli et Klebsiella représentent à elles seules 77% des germes isolés dans les urines. Ces germes ayant montré une très bonne sensibilité aux aminosides, à la nitrofurantoïne, à la ciprofloxacine et à l’acide nalidixique, ces antibiotiques sont indiqués pour être utilisés en première intention dans les infections urinaires. La même conclusion est valable pour les germes isolés des écouvillons vaginaux. D’après les chiffres recueillis dans un hôpital parisien en 1976(Hôpital Henri-Mondor) ; les antibiotiques que nous avons trouvés actifs sur E.Coli dans notre étude, l’étaient aussi à l’hôpital Henri-Mondor, par contre Klebsiella commencait déjà à montrer une résistance pour certains antibiotiques que nous avons trouvés actifs dans notre étude : par exemple la nitrofurantoïne representait déjà à cette époque plus de 50% de souches résistantes.

2.      Les Staphylocoques représentent à eux seuls près de 40% des germes isolés dans les pus ; il est très sensible à la céfalotine, aux aminosides, à la ciprofloxacine, à l’eryhromycine et à la lincomycine. Il est suivi par E.Coli, Klebsiella, Proteus et Pseudomonas qui représentent près 50% des germes. Ces derniers pourront être traités avantageusement par la gentamicine et la ciprofloxacine. En 1976 à l’hôpital Henri-Mondor, le staphylocoque aureus montrait déjà une résistance de 85% sur la pénicilline G et nous nous avons trouvé une résistance de 77.5% pour ces dix dernières années. A cette époque le Pseudomonas était résistant à 100% pour l’ampicilline, résistant à plus de 95% pour la chloramphénicol, l’acide nalixique, la nitrofurantoïne et le triméthoprime-sulfamethoxazole.

3.      Les Salmonella, Staphylocoques, et Klebsiella représentent à eux seuls près de 70% des germes isolés dans les hémocultures. Ces germes pourront être traités avantageusement par la ciprofloxacine, les aminosides et l'erthromycine, la lincomycine l'oxacilline pour les Staphylocoques.

4.      Dans les selles, les Shigella et les Salmonella représentent  97.99% des germes isolés ; on pourra avantageusement recourir pour les souches de Shigella à l’acide nalixique , à la ciprofloxacine, à la céfalotine et aux aminosides et pour les souches de Salmonella la tetracycline, la chloramphénicol, l'amikacine, la tobramycine, la ciprofloxacine et l'acide nalidixique.

5.      Pour ce qui concerne les germes qui ont été isolés dans le L.C.R., les Pneumocoques, les Klebsiella, les méningocoques, les Pseudomonas, et les Salmonella totalisent à eux seuls 63.17% des germes isolés dans le L.C.R., les antibiotiques qui ont été actifs à ces germes sont en général les aminosides, la ciprofloxacine, l'acide nalidixique, l'oxacilline, l'erytromycine, et la pénicilline.

D’une façon générale, nous avons remarqué que les aminosides et la ciprofloxacine agissent d’une façon  satisfaisante sur tous les germes étudiés. Par contre l’ampicilline agit très faiblement sur les germes étudiés.
Le chloramphénicol a montré une bonne activité sur S.aureus, Salmonella, Enterobacter, Pneumocoque, Entérocoques, Méningocoques, Gonocoque et les streptecoques.

Par contre l’activité est plus faible sur Proteus, Acinetobacter, Pseudomonas, Shigella et Salmonella typhi.
Le triméthoprime sulfaméthoxazole a montré une bonne activité sur les Pneumocoques, une activité moyenne sur Enterobacter et Staphylocoque; et une activité en dessous de la moyenne pour les autres souches.
La tétracycline a montré une bonne activité sur les Salmonella, les Pneumocoques et sur les Méningocoques, et une activité moyennne sur Entérobacter et Klebsiella, et une activité en dessous de la moyenne pour les autres souches.
La nitrofurantoïne a montré une très bonne activité sur tous les germes à l’exception des Proteus, Acinetobacter et Pseudomonas.
L’acide nalidixique a montré une très bonne activité sur tous les germes étudiés à l’exception des Pseudomonas.
La céfalotine a montré une très bonne activité sur les Staphylocoques, Entérocoque, Shigella et Pneumocoque,Streptocoques sp., Gonocoques. Elle a une activité moyenne sur E.Coli et Klebsiella. Son activité est médiocre sur les autres germes.
L'amoxicilline a montré une activité médiocre sur presque tous germes étudiés.
L’erythromycine et la lincomycine ont une très bonne activité sur les Staphylocoques, et le pneumocoque.Et l'erythromycine a montré une bonne activité sur les Méningocoques et les Gonocoques.
L’oxacilline agit très bien sur les Staphylocoques, le pneumocoque et le Méningocoque; par contre son activité est médiocre sur l’entérocoque et le Gonocoque.

V. BIBLIOGRAPHIE  

1)      AVRIL J.-L., Bactériologie clinique, edition marketing, Paris,1992.

2)      AZELE F., Bactériologie médicale, edition Crouan et Roques, Lille, 1982.

3)      DUVAL J.;SOUSSY, Antibiothérapie, edition Masson, Paris, 1977.

4)      MINOR L.; VERON, Bactériologie médicale, edition Flammarion, 1989.

5)      TURPIN R.,VELU H., Thérapeutique antibiotiques, DOIN, Paris, 1957.

6)      VANDEPITTE J., Bactériologie clinique, technique de base pour le laboratoire, Organisation Mondiale pour la Santé, Genève, 1994.

Dossier transmis le 3 septembre 2001 par Marc TWAGIRUMUKIZA - twamarc@santetropicale.com

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